由於本鄉兩島母岩之地質多為第三紀之酸性火山岩，長年經風吹浪侵的風化機械切割作用，常堆積成島礁或崩岩堆，再經海浪沖刷累積於澳口形成細沙灘，蔚為地質獨特景觀。
本鄉原屬地勢陡峭的沿海島嶼，歷數千年風吹、日曬、雨淋、岩石一經風化，立刻產生搬運作用，使土壤不易就地化育，只能形成沖刷殘餘之石質土或局部之幼年土壤，肥力較差，比較適合耕作地瓜、西瓜……等乾旱作物，由於強風將海水吹至陸地，增加境內土壤的鹽分，其土壤多呈淺紅色和棕紅色，表土較粗，略帶有鹼性。其主要土壤類別性質如下：
本區兩大島之東北側海岸，斷岩溝谷普遍形成，特別發達，其高度有時達幾十公尺，此種岩谷之形成，皆賴地面水下切侵蝕與風化之結果所致，而物理風化比化學風化為甚。
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